Le laboratoire de cartographie constitue la base d’acquisition et concentration de l'information géographique de l’INRH.  Sa mission consiste en l’utilisation de la cartographie numérique au service de la recherche en domaine halieutique et milieu marin, dans le but de créer une plate-forme de capitalisation de l'information et des savoir-faire en matière de cartographie moderne.
L’activité de recherche du Laboratoire de Cartographie se résume en trois axes principaux